Cikal bakal berdirinya organisasi kemahasiswaan ini disebabkan banyak persoalan internal kampus dan kajian-kajian keagamaan, khususnya Tafsir dan Hadis yang perlu diwadahi oleh badan ekstra kampus.

Diawalilah komunikasi antara personal BEMJ TH Yogyakarta dengan BEMJ TH Bandung dan Jakarta. Pembicaraan mengarah pada usulan untuk mengadakan seminar Nasional Studi Qur’an sekaligus rencana penyelenggaraan Musyawarah Nasional Mahasiswa Tafsir-Hadis se-Indonesia di bulan Maret-April tahun 2000, yang diketuai Suryo Putro (TH 1998) dan Sekretaris M. Nur Syahid (TH 1998). Kami mengundang tim BEMJ TH IAIN Jakarta dan Bandung untuk mematangkan rencana penyelenggaraan Seminar Nasional dan Munas FKMTHI.

Hasil utama kegiatan ini adalah pendeklarasian Forum Komunikasi Mahasiswa Tafsir-Hadis yang secara resmi didirikan pada tanggal 25 September 2000 di Yogyakarta. Munas berhasil membentuk kepengurusan FKMTHI periode 2000-2002. Dan Ahmad Karsidin Al-Janky (IAIN Walisongo Semarang) dipercaya sebagai Sekjen yang membawahi 14 anggota Majelis Pertimbangan Forum (MPF).